Программы
PhageAnalyzer 2.0 — программа для анализа результатов полногеномного секвенирования бактериофагов
Компьютерная программа «PhageAnalyzer» позволяет проводить анализ данных полногеномного секвенирования бактериофагов. Создана база данных различных генов интеграз, токсинов, антибиотикорезистентности, эндолизинов и деполимераз, которые могу...
Rabies Analyzer — программа для генотипирования данных секвенирования вируса бешенства
Программа «RabiesAnalyzer» предназначена для анализа мутаций и определения группы принадлежности изолятов вируса бешенства Rabies lyssavirus по загруженной последовательности полного генома или N гена. В качестве исходных данных используетс...
Yersinia pseudotuberculosis Analyzer
Программа _«__Yersinia_ _pseudotuberculosis_ _Analyzer__»_ предназначена для анализа полногеномных последовательностей штаммов _Yersinia_ _pseudotuberculosis_ с целью определения наличия генов вирулентности и плазмид, анализа генов, отвеча...
Klebsiella Analyzer — программа для анализа данных полногеномного секвенирования Klebsiella pneumonia
Отечественная программа KlebsiellaAnalyzer позвоялет проводить типирование и анализ данных полногеномного секвенирования клинических изолятов Klebsiella pneumoniae. Для разработки программного обеспечения использовали языки программирования...
Fragment Extractor — программа для анализа нуклеотидных последовательностей
Программа «Fragment Extractor» предназначена для анализа данных фрагментарного и полногеномного секвенирования с целью поиска различных нуклеотидных последовательностей. Дополнительными функциями программы являются возможность трансляции на...
Resistance Analyzer — программа для поиска генов антибиотикорезистентности
оффлайн программа для поиска генов антибиотикорезистентности в данных полногеномного секвенирования. Программа предназначена для работы в среде Windows.
MLST typer — программа для мультилокусного сиквенс-типирования (MLST) на основе данных полногеномного секвенирования
Программа «_MLSTtyper_» предназначена для анализа данных полногеномного секвенирования возбудителей бактериальных инфекций с целью определения аллелей генов, используемых для типирования, и MLST-типа. Принципиальными особенностями программы...
Pseudomonas Analyser — программа для анализа геномов Pseudomonas aeruginosa
Программа _«__Pseudomonas_ _Analyser__»_ предназначена для анализа данных полногеномного секвенирования штаммов _Pseudomonas_ _aeruginosa_ с целью определения антигенной структуры, жгутикового антигена, выявления факторов патогенности, гено...
«V. cholerae ICE Genotyper» — программа для выявления и типирования интегративно-конъюгативного элемента (ICE-элемента) ...
Программа «_V. cholerae ICE Genotyper_» предназначена для анализа данных полногеномного секвенирования штаммов _Vibrio_ _cholerae_ с целью выявления интегративно-конъюгативного элемента (ICE-элемента) и определения его типа. Возможна пакетн...
«Salmonella Analyzer» — программа для анализа данных полногеномного секвенирования Salmonella spp.
Программа _«__Salmonella_ _Analyzer__»_ предназначена для анализа данных полногеномного секвенирования штаммов _Salmonella_ _spp__. _с целью определения антигенной структуры, выявления факторов патогенности, определения INDEL-локусов с высо...
SiderophoreAnalyzer
Программа для выявления генов, отвечающих за синтез сидерофоров, в полногеномных нуклеотидных последовательностях энтеробактерий Разработанная программа позволяет проводить анализ данных секвенирования таких представителей энтеробактер...
SARS-CoV-2 Spike Analyzer Онлайн анализ полиморфизмов Spike-белка возбудителя новой коронавирусной инфекции
Для анализа нужен файл в формате .fasta, содержащий одну последовательность. В случае фрагментарного сиквенса, все фрагменты должны быть объединены в общую последовательность
CovAnalyzer — программа для определения геновариантов SARS-CoV-2
Предлагаемая программа предназначена для поиска мутаций в последовательностях штаммов SARS-CoV-2 с выравниванием на референсную последовательность и определения геновариантов вируса.
SARS-CoV-2 Genome Analyzer — программа для анализа результатов полногеномного секвенирования возбудителя новой коронавир...
SARS-CoV-2 Genome Analyzer позволяет проводить анализ данных полногеномного секвенирования вируса SARS-CoV-2. В основе метода лежит выравнивание анализируемой последовательности на референсную последовательность штамма Wuhan-Hu-1 с последую...
Pasteurella Analyzer — программа для обработки данных метагеномного анализа микроорганизмов семейства Pasteurellaceae
Компьютерная программа, позволяющая проводить анализ данных метагеномного анализа микроорганизмов семейства Pasteurellaceae с целью поиска генов антибиотикорезистентности и генов, кодирующих токсины.
ChromatoAnalyzer – программа для анализа данных газовой хромато-масс-спектрометрии (ГХ/МС)
Компьютерная программа, позволяющая проводить анализ данных хромато-масс-спектрометрии в режиме селективного ионного мониторинга (SIM — selected ion monitoring). Поддерживается пакетный режимы работы программы, позволяющий в автоматическом ...
SeqAnalyzer — программа для анализа результатов полногеномного секвенирования Vibrio cholerae
SeqAnalyzer позволяет проводить анализ данных полногеномного секвенирования штаммов холерного вибриона. В основе метода лежит поиск заранее определенных референсных генов среди набора контигов, что позволяет определять вид, серогруппу, биов...