SNP Genotyper - программа для определения генетических линий у токсигенных штаммов Vibrio cholerae седьмой пандемии на основе данных полногеномного секвенирования
- Автор: Водопьянов А.С., Водопьянов С.О., Писанов Р.В.
Программа «SNP Genotyper» предназначена для быстрого анализа данных полногеномного секвенирования штаммов Vibrio cholerae седьмой пандемии с целью определения их генетической линии. Определение генетической линии проводится на основе заложенных в программу ранее выявленных маркерных SNP (единичных нуклеотидных замен), характерных для каждой из линий.
Возможна пакетная обработка множества fasta-файлов (каждый файл содержит геном одного штамма). Результат выдается в табличной форме
Возможна пакетная обработка множества fasta-файлов (каждый файл содержит геном одного штамма). Результат выдается в табличной форме
Общее филогенетическое дерево