SNP Genotyper - программа для определения генетических линий у токсигенных штаммов Vibrio cholerae седьмой пандемии на основе данных полногеномного секвенирования

SNPGenotyper.jpg
  • Автор: Водопьянов А.С., Водопьянов С.О., Писанов Р.В.

SNPGenotyper.jpg

Программа «SNP Genotyper» предназначена для быстрого анализа данных полногеномного секвенирования штаммов Vibrio cholerae седьмой пандемии с целью определения их генетической линии. Определение генетической линии проводится на основе заложенных в программу ранее выявленных маркерных SNP (единичных нуклеотидных замен), характерных для каждой из линий.

Возможна пакетная обработка множества fasta-файлов (каждый файл содержит геном одного штамма). Результат выдается в табличной форме

SNP Genotyper table
Общее филогенетическое дерево
SNPGenotyper_phylo.jpg

SNPGenotyper.7z

Скачать (Размер 61090 Kb) Тип файла: 7z

SNPGenotyper.jar

Скачать (Размер 136 Kb) Тип файла: jar

SNPGenotyper_phylo.jpg

Скачать (Размер 760 Kb) Тип файла: jpg