PhageAnalyzer 2.0 — программа для анализа результатов полногеномного секвенирования бактериофагов

• Автор: Погожова М.П., Водопьянов А.С., Гаевская Н.Е., Писанов Р.В., Водопьянов С.О., Олейников И.П.

Компьютерная программа «PhageAnalyzer» позволяет проводить анализ данных полногеномного секвенирования бактериофагов. Создана база данных различных генов интеграз, токсинов, антибиотикорезистентности, эндолизинов и деполимераз, которые могут быть встроены в фаговый геном, а также разработано программное обеспечение для их поиска. Эта информация позволяет определить тип бактериофага (умеренный или вирулентный), а также установить носительство генов патогенности и антибиотикорезистентности бактерий.

Программа может быть использована как для анализа данных секвенирования бактериофагов полученных как непосредственно исследователями, так и скачанными из доступных баз данных нуклеотидных последовательностей.

Отличительные особенности программы PhageAnalyzer:

• Низкие требования к оборудованию – для работы требуется обычный «офисный» компьютер или ноутбук с 1 Гб оперативной памяти
• Высокая скорость работы – на анализ данных одного генома (около 10 Мб) требуется 3-4 минуты
• Простота управления – программа разработана по принципу «одной кнопки» — никаких дополнительных настроек или специальных знаний не требуется
• Программа рассчитана на работу с набором контигов, что не требует проведения предварительной сборки генома
• Простота оценки результатов – данные анализа данных полногеномного секвенирования представляют собой интуитивно понятный текстовый файл на русском языке.

Скачать PhageAnalyzer

• Полная версия – предназначена для компьютеров с операционной системой Windows XP, 7, 8 без установленной виртуальной машины JAVA (JRE). В этом случае для запуска программы достаточно распаковать скачанный архив с программой и запустить файл PhageAnalyzer.bat
• Исполняемый файл – предназначен для компьютеров с установленной виртуальной машиной JAVA (JRE) на базе Windows, Linus, Mac OS X. При необходимости свежую версию JRE можно бесплатно скачать с официального сайта компании Oracle (www.oracle.com). При этом запускаемым файлом является PhageAnalyzer.jar

Программа PhageAnalyzer внесена в Реестр программ для ЭВМ, регистрационный № 2019616060 от 17.05.2019