PhageAnalyzer — программа для анализа результатов полногеномного секвенирования бактериофагов

Компьютерная программа «PhageAnalyzer» позволяет проводить анализ данных полногеномного секвенирования бактериофагов. Создана база данных различных генов интеграз, токсинов и антибиотикорезистентности, которые могут быть встроены в фаговый геном, а также разработано программное обеспечение для их поиска. Эта информация позволяет определить тип жизненного цикла бактериофага (умеренный или вирулентный), а также установить носительство генов патогенности и антибиотикорезистентности бактерий.

Авторы: Погожова М.П., Водопьянов А.С., Гаевская Н.Е., Писанов Р.В., Водопьянов С.О., Олейников И.П.

Анализ проводится на основе встроенной базы данных различных генов интеграз, токсинов и антибиотикорезистентности, которые могут быть встроены в фаговый геном. Эта информация позволяет определить тип жизненного цикла бактериофага (умеренный или вирулентный), а также установить носительство генов патогенности и антибиотикорезистентности бактерий.

Программа может быть использована как для анализа данных секвенирования бактериофагов полученных как непосредственно исследователями, так и скачанными из доступных баз данных нуклеотидных последовательностей.

Отличительные особенности программы PhageAnalyzer:

  • Низкие требования к оборудованию – для работы требуется обычный «офисный» компьютер или ноутбук с 1 Гб оперативной памяти
  • Высокая скорость работы – на анализ данных одного генома (около 10 Мб) требуется 3-4 минуты
  • Простота управления – программа разработана по принципу «одной кнопки» — никаких дополнительных настроек или специальных знаний не требуется
  • Программа рассчитана на работу с набором контигов, что не требует проведения предварительной сборки генома
  • Простота оценки результатов – данные анализа данных полногеномного секвенирования представляют собой интуитивно понятный текстовый файл на русском языке.

Скачать PhageAnalyzer

  • Загрузить полную версию – предназначена для компьютеров с операционной системой Windows XP, 7, 8 без установленной виртуальной машины JAVA (JRE). В этом случае для запуска программы достаточно распаковать скачанный архив с программой и запустить файл PhageAnalyzer.bat
  • Загрузить исполняемый файл – предназначен для компьютеров с установленной виртуальной машиной JAVA (JRE) на базе Windows, Linus, Mac OS X. При необходимости свежую версию JRE можно бесплатно скачать с официального сайта компании Oracle (www.oracle.com). При этом запускаемым файлом является PhageAnalyzer.jar

Программа PhageAnalyzer внесена в Реестр программ для ЭВМ, регистрационный № 2019616060 от 17.05.2019

Холера Грипп Чума Японский энцефалит Малярия Менингококковая инфекция Лихорадка Зика ГЛПС Коронавирусная инфекция Туляремия Бешенство Бешенство человека Осторожно, клещи! Малярия