• Суббота, Февраль 20th, 2016

Результаты научной деятельности института в 2015 г.отражены в следующих документах: 1 МУК и 3 МР федерального уровня внедрения (в разработке еще 1 СП и 1 Регламента институт принял участие в качестве соисполнителя);1 информационное письмо федерального уровня внедрения; 8 патентов; 3 базы данных; 1 ГИС; 1 программа для ЭВМ;142 опубликованных научных работы (из них: публикаций, индексируемых в РИНЦ, в том числе в журналах из перечня ВАК – 54; публикаций в других отечественных изданиях – 86; в зарубежной печати – 2; кроме того, сотрудники института являются соавторами 2 монографий); 9 разработанных документа внедрены на региональном уровне и 11 – на учрежденческом. Сотрудниками института представлено к защите 4 диссертации: 1 на соискание ученой степени доктора наук по специальности «микробиология» и 3 на соискание ученой степени кандидата наук по специальностям «эпидемиология» и «микробиология».

В 2015г.ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора завершено выполнение 17 научных тем:

1        В ходе выполнения темы «Совершенствование алгоритма молекулярно-биологического генотипирования возбудителя холеры» для анализа полногеномных сиквенсов разработано авторское программное обеспечение – программа АСТРОЛЯБИЯ. Программа имеет государственную регистрацию и позволяет проводить поиск налогов нуклеотидных последовательностей по любым локальным базам данных. Заблаговременное создание локальных баз данных нуклеотидных последовательностей любого возбудителя и использование программы АСТРОЛЯБИЯ полностью исключает необходимость использования зарубежного программного обеспечения (GenBank или аналоги) и предотвращает возможную утечку информации. В ходе компьютерного анализа локальной базы данных полногеномных сиквенсов холерного вибриона обнаружены INDEL-гены. К выявленным локусам сконструированы авторские праймеры. Разработана методика INDEL-типирования холерного вибриона.

2        Изучена возможность выявления атипичных форм холерного вибриона с помощью элективно-дифференциальных диагностических сред. Подобраны условия и среды, обеспечивающие индукцию и стабилизацию атипичных форм холерного вибриона. Стабилизированы субкультуры штаммов холерного вибриона, характеризующиеся способностью вырастать в виде ругозных и шероховатых колоний. Дана сравнительная оценка ростовых свойств диагностических питательных сред при выращивании штаммов холерного вибриона с атипичными свойствами. Изучена возможность использования различных элективных питательных сред, обеспечивающих реверсию ругозных и шероховатых колоний в установленные сроки.

3        Изучены иммуногенные и протективные свойства препаратов наружных мембран холерного вибриона. Впервые получены в щадящих условиях препараты внешних мембран из штаммов Vibriocholerae с разным составом структурных белков, изучены их апоптогенная активность и цитотоксическое действие на иммунокомпетентные клетки invivo и invitro. Оценена иммуногенность и протективность выделенных препаратов, их влияние на развитие, течение и исход экспериментальной холеры. Предложены оптимальные иммунизирующие дозы и схемы применения препарата наружных мембран, выделенных из V. choleraeElTor 18950 (ctx, tcp, OmpT+, OmpU, OmpW+), предотвращающие развитие инфекционного процесса у экспериментальных животных.

4        В рамках темы «Формирование коллекции белковых профилей масс-спектров различных представителей вида Vibriocholerae для создания базы данных» впервые штаммы V. cholerae разных биоваров, серологических групп и токсигенности охарактеризованы по спектру белков. Сравнительный анализ масс-пик листов позволил получить новые данные об отличительных особенностях состава рибосомальных белков характерных для представителей каждой группы холерных вибрионов. Впервые создана персональная база данных масс-спектров холерных вибрионов О1, О139, не О1/ не О139 серогрупп, что позволит проводить идентификацию V. cholerae в формате масс-спектрометрического анализа.

5        В ходе выполнения темы «Мониторинг антибиотикорезистентности условно-патогенных для человека микроорганизмов поверхностных водоемов г. Ростова-на-Дону: создание баз данных штаммов, представляющих потенциальную угрозу для биобезопасности региона» впервые в регионе ЮФО проведены исследования по качественному составу условно-патогенной микрофлоры, изучению влияния температурного режима на микробиоценозы водных объектов; впервые изучена устойчивость УПМ, выделенных из водоемов к антимикробным препаратам для оценки потенциальной опасности появления в водной среде поли- и панрезистентных микроорганизмов; впервые создана компьютерная база УПМ водных экосистем региона, включающая фенотипические, тинкториальные характеристики выделенных штаммов, а также профили антибиотикорезистентности изолятов.

6        В рамках темы «Совершенствование серологической диагностики холеры» сконструированы отсутствующие в настоящее время в практике отечественные антигенные диагностические препараты на полимерных носителях, с использованием как тотальных клеточных лизатов холерного вибриона, так и серовароспецифического липополисахарида, а также эритроцитарный диагностикум для выявления противохолерных антител в сыворотках больных и подозрительных на заболевание холерой людей. Готовитсяпакет документов для регистрации антигенных полимерных лизатных О1 и О139 холерных диагностических препаратов, диагностического препарата на основе ЛПС V. сholerae О1. Проведены комиссионные (межлабораторные) испытания.Оформлена и утверждена НТД, включая технические условия и проект инструкций по применению. Наработаны экспериментальные серии диагностических препаратов.

7        В ходе выполнения темы «Эпидемиологическая диагностика новых и возвращающихся инфекционных болезней: лихорадка Западного Нила, Крымская геморрагической лихорадка и другие арбовирусные инфекции» впервые разработан алгоритм оценки эпизоотического состояния природного очага при КГЛ с использованием проблемно-ориентированной базы данных «Крымская геморрагическая лихорадка. Эпизоотическое состояние природного очага. Ростовская область», а также применена концепция предэпидемической диагностики при ЛЗН, КГЛ и других арбовирусных инфекциях. Впервые разработаны эпидемиологические типы заболеваемости при ЛЗН: природно-очаговый, природно-антропоургический и антропоургический с соответствующими подтипами. Разработан алгоритм эпидемиологической диагностики при ЛЗН, КГЛ и других арбовирусных инфекциях на основании полученных результатов.

8        В рамках темы «Сибирская язва в Ростовской области в современный период» проведен учет сибиреязвенных очагов Ростовской области с 1882 г. по 2015 г. в электронном виде и издан Атлас с указанием эпидзначимых данных. Создана геоинформационная система «Сибирская язва. Ростовская область», содержащая сведения о заболеваемости сибирской язвой людей и сельскохозяйственных животных за 132 года (1882-2014 гг.).

9        Впервые изучено влияние комплексного иммуноглобулинового препарата (КИП) на течение экс­периментальных инфекций, вызываемых представителями рода YersiniaY. pseudotu­berculosis и Y. enterocolitica. Оценено действие КИП на клеточный и гуморальный иммунный ответ при заболеваниях, вызванных патогенными для человека штаммами Yersiniapseudotuberculosisи Y. еnterocolitica, а также на развитие, течение и исход инфекционных процессов у экспериментальных животных. Установлено положительное влияние этого препарата на функциональную активность фагоцитов, процессы антителопродукции и утилизации образовавшихся иммунных комплексов. Предложена экспериментальная модель инфекций (патент № 2566188), позволяющая оценить эффективность применения КИП при псевдотуберкулезе и кишечном иерсиниозе.

10        В рамках темы «Дифференциация бактериофагов различных видов патогенных иерсиний» предложена система тест-культур, схема первичной идентификации фагов при мониторинге внешней среды. Составлена коллекция охарактеризованных фагов. Оформлены и утверждены методические рекомендации по идентификации и дифференциации бактериофагов патогенных иерсиний.

11        В ходе выполнения темы «Конформационно измененные формы 370-ного ЛПС вирулентного штамма Yersiniapestis 231: токсичность и TNF-α- / INF-γ-индуцирующая активность» определена роль конформационных изменений в реализации токсического потенциала ЛПС37 вирулентного штамма Y. pestis 231. На основании результатов invivo и invitro составлена общая схема передачи сигнала TLR4/MD2 под воздействием исходных и конформационно измененных форм ЛПС37 Y. pestis 231. Впервые установлено, что доминантность их сигнальных путей и кросс-регуляция проводимого сигнала двух форм ЛПС зеркально противоположны. В результате чего исходная форма ЛПС индуцирует синтез интерферонов, а конформационно изменённая – провоспалительных цитокинов, что соответствует иммунному ответу организма на внутриклеточной и внеклеточной стадиях инфекционного процесса.

12        Изучена изменчивость свойств патогенных для человека вибрионов при трансдукции. Внедрён в лабораторную практику метод дифференциации штаммов и бактериофагов парагемолитических вибрионов (акт внедрения ФКУЗ «Северо-Кавказская противочумная станция» Роспотребнадзора от 12.01.2011 г.), на основе патента на изобретение «Способ обнаружения микроорганизма вида Vibrioparahaemolyticus».

13        В рамках темы «Формирование коллекции патогенных для человека вибрионов» расширена коллекция галофильных патогенных для человека вибрионов и сформирована коллекция алгинолитических вибрионов, выделенных на территории России и стран ближнего и дальнего зарубежья в период с 1973 по 2014 год для проведения фундаментальных и прикладных научных исследований. Усовершенствована схема лабораторной диагностики заболеваний, вызываемых парагемолитическими и другими патогенными для человека вибрионами. Направлен на утверждение Проект методических указаний «Лабораторная диагностика заболеваний, вызываемых парагемолитическими и другими патогенными для человека вибрионами». Коллекционная деятельность обеспечена базами данных, каталогом, инструкцией по лиофильному высушиванию микроорганизмов.

14        Изучена природная и экспериментальная устойчивость к антибактериальным препаратам патогенных для человека холерных вибрионов не О1 — не О139 серогрупп, этиотропная терапия инфекции. Впервые проведен анализ встречаемости маркеров антибиотикорезистентности и их сочетаний у V.cholerae nonO1/ nonO139, выделенных от людей в 1968-2014гг.; доказан индуцибельный трансмиссивный характер устойчивости к ряду АБ; доказана возможность экспрессии R-плазмид различных групп несовместимости (incC, J, S) в клетках V.cholerae nonO1/ nonO139. Разработаны методические рекомендации «Этиотропная терапия холеры и других инфекций, вызванных холерными вибрионами».

15        В рамках темы «Мониторинг судовых балластных вод международного морского транспорта в бассейне Азовского моря» впервые на территории РФ проведены исследования на наличие возбудителей холеры проб балластных вод, отобранных на судах смешанного «река-море» плавания. На основании результатов проведенного микробиологического, в т.ч. генетического анализа, штаммов V. cholerae non O1/ non O139, изолированных в прибрежной зоне Таганрогского залива и выделенных из судовых балластных вод доказан заносной характер последних, что свидетельствует о выявлении нового объекта эпиднадзора при холере в РФ. Впервые обнаружены редкие виды непатогенных вибрионов, ранее не выделявшиеся в акваториях морских портов Ростовской области, в том числе V. brasiliensis, V. rotiferianus, V. ponticus, отсутствующие в Руководстве по систематике бактерий Берджи, 2005 г. Впервые проведен мониторинг мест балластных операций в Азовском море и Таганрогском заливе с оценкой эпидемиологической опасности. Изучение гидрометеорологических особенностей Азовского моря и Таганрогского залива позволило сделать вывод, что правило D-1 Конвенции в бассейне Азовского моря невыполнимо, приемлемым является способ D-2. Впервые проведена оценка балластных систем теплоходов различных проектов по их эпидемиологической опасности. На основании изучения балластных систем теплоходов впервые описаны и апробированы различные способы отбора проб балластной воды. Впервые оценена возможность выполнения Стандарта качества балластных вод Международной конвенции о контроле и управлении судовыми балластными водами и осадками и обеспечено выполнение Постановления Правительства Российской Федерации № 256 от 28 марта 2012 года «О присоединении Российской Федерации к Международной конвенции о контроле судовых балластных вод и осадков и управлении ими 2004 года».

16        Создана ГИС «Распространение холерных вибрионов в объектах окружающей среды на территории Российской Федерации в 1989-2004, 2009-2014 гг.», которая включает фено- и генотипические свойства 962 штаммов, выделенных на территории Российской Федерации. С 2011 г. проведено расширенное ПЦР — типирование штаммов V. cholerae O1. С использованием ГИС проанализирована динамика выделения штаммов холерных вибрионов с разной генетической характеристикой (токсигенные, потенциально токсигенные и атоксигенные) на определенной административной территории.При проведении сравнительного анализа свойств штаммов V. сholerae О1 Эль Тор с разным набором генетических детерминант дополнительных токсинов, количество и уровни, экспрессии которых могут различаться от штамма к штамму установлено, что типирование по 25 генам является оптимально достаточным для выявления различий между штаммами (среди 200 штаммов выявлено 64 генотипа).

17        Изучено влияние стрессорных воздействий на свойства, обусловливающие персистенцию холерных вибрионов в организме человека и в объектах окружающей среды. Проведенное исследование показало, что стрессорное воздействие в виде низкой температуры, гипоксии, низкого и высокого рН, желчи оказывает выраженное влияние на фенотип холерных вибрионов, заключающийся, прежде всего, в модификации уровня токсинопродукции, биопленкообразования, изменения поверхностных структур, приводящих к снижению и утрате агглютинабельности и фаголизабельности. Стресс оказывает влияние на персистентный потенциал холерных вибрионов, вызывая в одних случаях повышение активности, в других – снижение, вплоть до утраты признака в стрессовых условиях. Указанные изменения носят регуляторный характер и не связаны с утратой генов, кодирующих признаки токсинопродукции, пили адгезии и продукции экзополисахарида.

 

Нормативно-методические документы, федерального уровня внедрения:

В качестве основного разработчика специалистами Ростовского-на-Дону противочумного института переработаны:

1  Методические указания «Лабораторная диагностика холеры».

В качестве основного разработчика специалистами Ростовского-на-Дону противочумного института разработаны:

2  Методические рекомендации «Идентификация и дифференциация бактериофагов патогенных иерсиний (Yersiniapestis, Yersiniapseudotuberculosis, Yersiniaenterocolitica.

3  Методические рекомендации «Расчет стандартных значений экономического ущерба, наносимого одним случаем холеры (больной холерой, вибриононоситель), с учетом комплекса противохолерных мероприятий».

4  Методические рекомендации «Отбор и микробиологическое исследование балластных вод морских (речных) судов, выполняющие рейсы в морские порты неблагополучных по холере стран».

В качестве соисполнителей, специалистами Ростовского-на-Дону противочумного института переработаны:

5  Проект Регламента «Порядок функционирования специализированных противоэпидемических бригад (СПЭБ) Роспотребнадзора в области обеспечения санитарно-эпидемиологического благополучия населения».

6  Санитарные правила «Профилактика чумы».

 

Информационные письма, федерального уровня внедрения:

—   Информационное письмо «Об эпидобстановке по холере 2005-2014 гг. Прогноз на 2015 г.»

 

Депонированные, паспортизованные штаммы:

1    Депонирование штамма Y. pestisсуперпродуцента сидерофора иерсиниахелина возбудителя чумы в ГКПБ «Микроб».

2    Депонирование в GenBank:

—   полногеномная последовательность ДНК штамма Vibrio cholerae 81 биовара Эль Тор серовара Инаба, выделенного в 2014 г. из воды реки Темерник на территории г. Ростова-на-Дону в июле 2014 г.;

—   нуклеотидные последовательности профагов CTX, RSX-кластераэтого же штамма;

—   нуклеотидная последовательность VSP-II этого же штамма;

—   нуклеотидные последовательности генов cefVibriocholerae разных серогрупп.

 

Документы регионального уровня внедрения:

1         Информационное письмо «О состоянии активности природного очага туляремии в Ростовской области»

2         Информационное письмо « О состоянии по туляремии в Российской Федерации»

3         Аннотированный библиографический указатель «Холера и патогенные для человека вибрионы» (за 2014 год).

4    6 информационных писем «О распространении в мире инфекционных болезней, регламентированных ММСП (2005 г.)».

 

Документация на иммунобиологические препараты:

Идет процесс государственной регистрации 2 питательных сред:

—     Питательная среда для выделения и культивирования возбудителя легионеллёза селективной (СЭЛ);

—     Плотная питательная среда для культивирования и выделения холерного вибриона, готовая к использованию после переплавки «Холерная дрожжевая среда агаризованная (ХДС – агар)».

Результаты научной деятельности института в 2016 г.

 

Результаты научной деятельности института в 2016 г. отражены в следующих документах федерального уровня внедрения: 1 СП и 1 МР (в разработке еще 1 СП, 2 МУ, 1 Руководства и 1 Атласа институт принял участие в качестве соисполнителя); 2 информационных письма; еженедельные Аналитические справки и Информационные бюллетени; 5 патентов; 1 база данных; 5 депонированных штаммов и гибридом, 55 депонированных нуклеотидных последовательностей; 169 опубликованных научных работ (из них: публикаций, индексируемых в РИНЦ – 83, в том числе в журналах из перечня ВАК – 43; 80 работ в других отечественных изданиях; 6 работ в зарубежной печати; сотрудники института являются соавторами 2 монографий); кроме того, еще 46 работ направлено в печать в издания ВАК; завершается процесс государственной регистрации 2 питательных сред; на сайте ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт создана «База данных нуклеотидных последовательностей микроорганизмов», доступная для сотрудников учреждений Роспотребнадзора. Еще 28 разработанных документов внедрены на региональном уровне и 9 – на учрежденческом. Сотрудниками института защищено 3 диссертации на соискание ученой степени кандидата наук по специальностям «эпидемиология» и «микробиология»; 1 докторская диссертация представлена к официальной защите; 1 докторская диссертация представлена к апробации в институте; еще над 2 докторскими и 8 кандидатскими диссертациями работа продолжается.

 

В 2016г. ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора завершено выполнение 7 научных тем:

  • Разработаны видоспецифические моноклональные пероксидазные конъюгаты для идентификации холерных вибрионов О1 и О139 серогрупп прямым методом ТИФА и дот-ИФА как в стационарных, так и полевых условиях (без приборного обеспечения). Их применение исключает возможность перекрестных реакций с представителями близкородственных микроорганизмов, необходимость использования дорогостоящих антивидовых конъюгатов, сокращает общее время анализа до 70-90 минут. Получены и апробированы лабораторно-экспериментальные серии пероксидазных конъюгатов на основе МКА к мембранным белкам для детекции tcp+ штаммов холерных вибрионов О1, О139 серогрупп в прямых методах ИФА. Подготовлена нормативная документация на диагностический набор «Иммуноглобулины моноклональные диагностические, меченные пероксидазой хрена, сухие для серологической идентификации cholerae О1 и О139 (in vitro) методом ИФА и дот-ИФА».
  • Изучена цитокининдуцирующая активность вирулентных и изогенных ЛПС-дефектных авирулентных (cap) вариантов туляремийного микроба у хозяев различной чувствительности к инфекции. Выявленные отличия могут определять особенности патогенеза туляремии и способствовать поиску мишеней для разработки иммунотерапии туляремии.
  • Изучено значение липополисахарида в формировании устойчивости Francisella tularensis к β-лактамным антибиотикам. Показано, что, неионогенные поверхностно-активные вещества (тритон Х-100, твин 80), повышая проницаемость клеточной стенки бактерий, достоверно снижают устойчивость tularensis к цефалоспоринам in vitro. Полученные результаты перспективны для повышения эффективности известных антибиотиков за счет использования в качестве растворителя неионогенных поверхностно-активных веществ.
  • Изучение белковых профилей типичных штаммов tularensis трех основных подвидов показало, что использование MALDI-TOF масс-спектрометрии позволяет не только идентифицировать штаммы, но и с высокой степенью достоверности определять их подвидовую принадлежность. Установлено, что аттенуация вирулентных штаммов туляремийного микроба, обусловленная повреждениями в структуре ЛПС, не приводит к существенным изменениям белкового профиля штаммов.
  • Установлено, что штаммы неосновных подвидов Yersinia pestis имеют в составе генома большее количество SNP, что может свидетельствовать о более продолжительном времени существования этих подвидов. Филогенетический анализ позволил разделить штаммы подвида ssp. caucasica на несколько генотипов, выявлено большое родство штаммов из Центрально-Кавказского очага и Ирана. Определены SNP, отличающие штаммы основного подвида от неосновных. Эти данные позволили разработать набор реагентов, позволяющий в ПЦР в реальном времени проводить дифференциацию эндемичных и эпидемичных штаммов возбудителя чумы с помощью праймеров и аллель – специфических зондов.
  • Осуществлен анализ механизмов влияния ингибитора секреции сидерофоров на патогенные свойства возбудителя чумы. Определена специфичность продукции и действия ингибитора секреции сидерофоров, а также его химическая структура, детерминанты и мишень действия на pestis.
  • Пополнены информационно-библиографические базы данных «Холера и патогенные для человека вибрионы» (с 1987 г.) и «Чума» (с 1990 г.). Указанные базы данных содержат 12965 и 6645 рефератов соответственно. Выпущены библиографические указатели «Холера и патогенные для человека вибрионы» и «Чума». Для оценки состояния и тенденций в динамике заболеваемости чумой в мире пополняется база данных «Чума. Мир» (ретроспектива с 1959 г.), содержащая данные о чуме в мире по 44 странам, в том числе по странам Азии, Америки, Африки и Европы.

 

Нормативно-методические документы, федерального уровня внедрения:

В качестве основного разработчика:

  • Специалисты института участвовали в подготовке данных к изменениям в санитарно-эпидемиологических правилах СП 3.1.1.2521-09 «Профилактика холеры. Общие требования к эпидемиологическому надзору за холерой на территории Российской Федерации».
  • Специалистами института разработаны МР «Порядок определения эпидемического потенциала административной территории для районирования Российской Федерации по типам эпидемических проявлений холеры». Методические рекомендации одобрены Ученым советом (протокол № 2 от 08.04.2016г.), утверждены директором института и направлены для утверждения в Федеральную службу по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека.

 

В качестве соисполнителей, специалистами Ростовского-на-Дону противочумного института переработаны:

  • СП 3.1.7.2492-09 «Профилактика чумы»;
  • МУ 3.4.2552-09 «Организация и проведение первичных противоэпидемических мероприятий в случаях выявления больного (трупа), подозрительного на заболевания инфекционными болезнями, вызывающими чрезвычайные ситуации в области санитарно-эпидемиологического благополучия населения»;
  • Методические указания. Организация, обеспечение и оценка противоэпидемической готовности медицинских организаций к проведению мероприятий в случае заноса или возникновения очага особо опасных инфекционных болезней и инфекционных болезней неясной этиологии, вызывающих чрезвычайные ситуации в области санитарно-эпидемиологического благополучия населения Российской Федерации. Взамен МУ 3.4.1030-01 «Организация, обеспечение и оценка противоэпидемической готовности медицинских учреждений к проведению мероприятий в случае завоза или возникновения особо опасных инфекций, контагиозных вирусных геморрагических лихорадок, инфекционных болезней неясной этиологии, представляющих опасность для населения Российской Федерации и международного сообщения».

В качестве соисполнителей, специалисты Ростовского-на-Дону противочумного института приняли участие в разработке следующих документов:

  • Руководство по эпидемиологии инфекционных болезней. Раздел «Частная эпидемиология инфекционных болезней», глава «Холера».
  • Атлас возбудителей особо опасных бактериальных инфекционных болезней.

 

Информационные письма, федерального уровня внедрения:

—    Информационное письмо «Анализ эпидемиологической обстановки по холере в мире и в России в 2015 г. Прогноз на 2016 г.».

—    Информационное письмо: «Долгосрочный прогноз до 2040 г. по холере в рамках деятельности референс-центра  по мониторингу холеры в Российской Федерации».

—    Аналитические справки и Информационные бюллетени об эпидемиологической обстановке по холере в мире и в России еженедельно направлялись в Роспотребнадзор и размещались на сайте ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора.

—    Участие в составлении «Обзора и прогноза состояния популяций и численности мелких млекопитающих и членистоногих переносчиков природно-очаговых болезней, эпизоотологической и эпидемиологической обстановки в Российской Федерации».

 

Научно-техническая документация.

Патенты и базы данных:

  • Патент № 2575046 от 18.01.16 г. «Способ молекулярно-генетического типирования cholerae О1 и О139 серогрупп». Авторы: Водопьянов С.О., Водопьянов А.С., Олейников И.П., Мишанькин Б.Н.
  • Патент № 2580227 от 14.03.16 г. «Питательная среда для выделения Legionella pneumophila». Авторы: Шелохович А.И., Харабаджахян Г.Д., Терентьев А.И., Люкшина Е.Ю., Савельева И.К., Ульрих Е.П., Булахова О.Г.
  • Патент № 2595423 от 3.08.16 г. «Способ оценки адгезивных свойств холерных вибрионов cholerae El Tor и V. cholerae О139 на клеточной культуре HUTU-80». Авторы: Татаренко О.Н., Коршенко В.А., Титова С.В., Алексеева Л.П., Черепахина И.Я.
  • Патент № 2596401 от 10.09.16 г. «Способ дифференциации токсигенных и атоксигенных штаммов холерных вибрионов О1 серогруппы по ингибирующей активности». Авторы: Водопьянов С.О., Водопьянов А.С., Титова С.В.
  • Решение о выдаче патента от 20.09.16г. «Способ получения диагностикума для определения лечебного рекомбинантного α ‒ интерферона в сыворотке крови больных вирусными инфекциями». Авторы: Ларионова Л.В., Наркевич А.Н., Симакова Д.И., Кочеткова А.П., Лысова Л.К., Люкшина Е.Ю.
  • Свидетельство на базу данных № 2016620699 от 26.05.16г. «Гены Vibrio parahaemolyticus, содержащие INDEL-маркеры». Авторы: Водопьянов С.О., Чемисова О.С., Водопьянов А.С., Олейников И.П.

 

Депонированные, паспортизованные штаммы:

  • Штамм V. cholerae nonO1/nonO139 Р-19260 (КМ 254), содержащий гены cholix-токсина (chxA) соответственно I типа.
  • Штамм V. cholerae nonO1/nonO139 Р-912 (КМ 255), содержащий гены cholix-токсина (chxA) III типа.
  • Штамм cholerae non-O1, non-O139 Р-17449 (КМ 255), содержащий аллель гена rstRenv.
  • Штамм parahaemolyticus — продуцент TDH.
  • Тест-штамм cholerae El Tor предназначенный для репродукции новой расы холерных фагов, перспективных для идентификации холерных вибрионов.
  • Гибридомы-продуценты моноклональных антител к мембранным белкам.

 

Депонирование в GenBank нуклеотидных последовательностей ДНК штаммов холерного вибриона:

—    2 островов патогенности VPI;

—    2 островов пандемичности VSP-II;

—    nan-nag-области VPI-2;

—    генов коровой области 5 профагов CTX;

—    профага RS1 и 6 pre-CTX;

—    профага CTX Sudan;

—    2 генов cholix-токсина (chxA);

—    3 генов гемагглютинин /протеазы (hapA);

—    13 генов цитотонического токсина cef;

—    4 генов cef;

—    2 генов rtxA;

—    12 генов chxA;

—    генов ctxAB7.

 

На сайте ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт создана «База данных нуклеотидных последовательностей микроорганизмов». База данных доступна для сотрудников учреждений Роспотребнадзора.

 

Документы регионального уровня внедрения:

  • МР «Тактика проведения эпизоотологических обследований и профилактических мероприятий в сочетанных очагах клещевых инфекций» (для Ростовской области). Методические рекомендации оформлены, согласованы с Управлением Роспотребнадзора по Ростовской области и ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Ростовской области» обсуждены на Учёном совете (протокол № 7 от 2.09. 2016г.), утверждены директором института.
  • Аннотированный библиографический указатель «Холера и патогенные для человека вибрионы» (за 2015 год).
  • 12 Информационных писем об эпидемиологической ситуации в мире по инфекционным болезням, регламентированных ММСП (2005 г.): ежемесячно осуществлялось информационное обеспечение Управления Роспотребнадзора по Ростовской области в соответствии с СП 3.4.2318-08 «Санитарная охрана территории Российской Федерации».
  • Информационные бюллетени об эпидемиологической обстановке в мире по инфекционным болезням, требующим проведение мероприятий по санитарной охране территории РФ, ежемесячно размещаются на сайте ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора.
  • Издан «Атлас эпизоотолого-эпидемиологической географии сибирской язвы в Ростовской области (справочно-кадастровые карты и таблицы по заболеваемости людей и животных)». Атлас содержит данные о проявлении инфекции за 1882 – 2014 гг. в каждом из 43 районов области. Атлас состоит из введения и трех разделов: в первом разделе дана классификация стационарно неблагополучных пунктов в Ростовской области; во втором разделе содержатся сведения о регистрации случаев заболевания людей и сельскохозяйственных животных за 132 года; в третьем разделе приведены электронные карты районов области с нанесенными стационарно неблагополучными пунктами, дана краткая экономико-географическая характеристика районов.
  • Разработан on-line вариант ГИС «Водоёмы г. Ростова-на-Дону».

 

Документация на иммунобиологические препараты:

  • Завершается процесс государственной регистрации плотной питательной среды для выделения и культивирования холерного вибриона, готовой к использованию после переплавки, холерной дрожжевой среды агаризованной (ХДС-агар). На базе аккредитованного испытательного центра – ФБУН «Научно-исследовательский институт физической и химической медицины» ФМБА проведены технические испытания питательной среды ХДС-агар, по результатам которых получено положительное заключение. Нормативная и эксплуатационная документация на среду ХДС-агар в составе регистрационного досье передана в регистрирующий орган – Росздравнадзор, проведена экспертиза на базе экспертной организации Росздравнадзора, успешно прошли клинико-лабораторные испытания на базе ФКУЗ Ставропольский НИПЧИ.
  • Завершается процесс государственной регистрации усовершенствованной на основе автолизата селезенки очищенного (АСО) питательной среды для выделения и культивирования возбудителя легионеллёза селективной, готовой к применению (СЭЛ). На базе аккредитованного испытательного центра – ФБУН «Научно-исследовательский институт физической и химической медицины» ФМБА проведены технические испытания питательной среды СЭЛ, по результатам которых получено положительное заключение. Нормативная и эксплуатационная документация на среду СЭЛ в составе регистрационного досье передана в регистрирующий орган – Росздравнадзор, проведена экспертиза на базе экспертной организации Росздравнадзора, успешно прошли клинико-лабораторные испытания на базе ФКУЗ Ставропольский НИПЧИ.
  • Для последующей государственной регистрации подготовлена и утверждена на ученом совете нормативная документация (Технические условия и Инструкция по применению) на диагностический набор «Иммуноглобулины моноклональные диагностические, меченные пероксидазой хрена, сухие для серологической идентификации V. cholerae О1и О139» прямым методом ТИФА и дот-ИФА как в стационарных, так и полевых условиях.
  • Разработан препарат диагностических холерных бактериофагов для идентификации холерных вибрионов О1 серогруппы. Успешно проведены межучережденческие лабораторные испытания препарата (акт о работе комиссии от 3. 06. 2016 г.). Составлена инструкция по его применению.