Resistance Analyzer – оффлайн программа для поиска генов антибиотикорезистентности в данных полногеномного секвенирования. Программа предназначена для работы в среде Windows.
Авторы: Водопьянов А.С., Писанов Р.В.
Язык программирования: Java
Скачать
Без рубрики ◊
• Sunday, November 12th, 2023
• Friday, September 15th, 2023
15 сентября 2023 года в г. Ростове-на-Дону на территории Парка культуры и отдыха 1 Мая состоялось торжественное мероприятие, посвящённое дню образования государственной санитарно-эпидемиологической службы России. Читать полностью…
Уважаемые коллеги!
Примите искренние поздравления с днём образования санитарно- эпидемиологической службы Российской Федерации!
Государственная санитарно-эпидемиологическая служба России обеспечивает санитарно-эпидемиологическое благополучие населения страны, несёт ответственность за жизнь и здоровье каждого гражданина, защищая от опасных инфекционных болезней. Наша общая благородная миссия ‒ сохранение здоровья населения России.
Читать полностью…
• Sunday, August 06th, 2023
В ФКУЗ Ростовском-на-Дону противочумном институте Роспотребнадзора планируется строительство клинико-диагностического центра.
https://disk.yandex.ru/i/tEkrVPSNz6Nlsg
• Friday, June 30th, 2023
30 июня 2023 года в завершении второго цикла мероприятий научно-практического кружка, организованного в рамках профориентационной работы со студентами медико-профилактического факультета Ростовского государственного медицинского университета по инициативе директора ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора А.К. Носкова и ректора ФГБОУ ВО РостГМУ Минздрава России С.В. Шлык, Читать полностью…
• Monday, June 26th, 2023
Программа «MLSTtyper» предназначена для анализа данных полногеномного секвенирования возбудителей бактериальных инфекций с целью определения аллелей генов, используемых для типирования, и MLST-типа. Принципиальными особенностями программы являются офлайн режим работы (без доступа к сети Интернет) и возможность автоматического анализа большого числа геномов.
Скачать
Скачать Методические рекомендации по работе с программой
Читать полностью…
• Monday, June 26th, 2023
Программа «Pseudomonas Analyser» предназначена для анализа данных полногеномного секвенирования штаммов Pseudomonas aeruginosa с целью определения антигенной структуры, жгутикового антигена, выявления факторов патогенности, генов определяющих мукоидный фенотип микроорганизма, определения INDEL-локусов с высокой разрешающей способностью.
Скачать Pseudomonas Analyser
- Загрузить полную версию – предназначена для компьютеров с операционной системой Windows XP, 7, 8 без установленной виртуальной машины JAVA (JRE). В этом случае для запуска программы достаточно распаковать скачанный архив с программой и запустить файл PseudomonasAnalyser.bat
- Загрузить исполняемый файл – предназначен для компьютеров с установленной виртуальной машиной JAVA (JRE) на базе Windows, Linus, Mac OS X. При необходимости свежую версию JRE можно бесплатно скачать с официального сайта компании Oracle (www.oracle.com). При этом запускаемым файлом является PseudomonasAnalyser.jar
- Загрузить методические рекомендации по использованию программы Pseudomonas Analyser.
• Friday, May 05th, 2023
5 мая 2023 года в ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора состоялось торжественное возложение цветов к мемориальной доске сотрудникам, погибшим на фронтах Великой Отечественной войны 1941–1945 годов: заместителю директора по АХЧ Шадрину, начальнику технического отдела Н.Т. Шульгину, бухгалтеру Е.М. Алексееву, инженеру М.А. Косинкову, научному сотруднику А.П. Яковлеву, зоологу Л.М. Губареву, заведующему складом Н. Мазину, шофёру В.И. Ванушенко, Н. Хасанжиеву и конюху Куценко. Читать полностью…
Уважаемые коллеги!
Примите сердечные поздравления с самым значимым для нас праздником ‒ Днём Победы в Великой Отечественной войне! 9 мая ‒ это символ героизма и беспримерного мужества нашего народа, отстоявшего мир на земле, а 1941-1945 годы ‒ одни из самых героических страниц в истории Отечества. Пусть эта Победа, этот важный подвиг наших дедов и прадедов навеки сохранится в памяти последующих поколений! Мы выражаем особую признательность тем, кто в эти дни мужественно выполняет свой воинский долг на поле боя. Пусть над нами всегда будет мирное небо, а в каждом доме ‒ счастье, благополучие и любовь! С праздником!
Директор ФКУЗ Ростовский-на-Дону
противочумный институт Роспотребнадзора А.К. Носков
27–28 апреля 2023 года состоялся конгресс с международным участием «Молекулярная диагностика и биобезопасность — 2023». В рамках научной программы конгресса, включающей 19 тематических секций и 145 докладов на самые актуальные темы современной эпидемиологии, молекулярной диагностики и биобезопасности, выступили с докладом сотрудники лаборатории молекулярной биологии природно-очаговых и зоонозных инфекций ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора: Читать полностью…
• Thursday, April 20th, 2023
Программа «V. cholerae ICE Genotyper» предназначена для анализа данных полногеномного секвенирования штаммов Vibrio cholerae с целью выявления интегративно-конъюгативного элемента (ICE-элемента) и определения его типа. Возможна пакетная обработка множества fasta-файлов (каждый файл содержит геном одного штамма).
Авторы
Водопьянов А.С., Водопьянов С.О., Писанов Р.В.
Скачать программу
Скачать методические рекомендации
• Thursday, April 20th, 2023
Программа «Salmonella Analyzer» предназначена для анализа данных полногеномного секвенирования штаммов Salmonella spp. с целью определения антигенной структуры, выявления факторов патогенности, определения INDEL-локусов с высокой разрешающей способностью.
Авторы
Горох А.М., Водопьянов А.С., Писанов Р.В., Водопьянов С.О., Герасименко А.А.
Читать полностью…
19 апреля 2023 года в г. Ростове-на-Дону участники ежегодной региональной научно-практической конференции, посвященной памяти доктора медицинских наук, профессора Тамары Алексеевны Кондратенко «Современные особенности эпидемиологии и профилактики инфекционных болезней в отдельных субъектах Российской Федерации» возложили цветы к памятнику великому советскому микробиологу и эпидемиологу Зинаиде Виссарионовне Ермольевой, научные открытия которой и сейчас используют в различных областях медицины и находят продолжение в деятельности ее учеников и последователей. Читать полностью…
• Tuesday, March 21st, 2023
Программа для выявления генов, отвечающих за синтез сидерофоров, в полногеномных нуклеотидных последовательностях энтеробактерий
Разработанная программа позволяет проводить анализ данных секвенирования таких представителей энтеробактерий, как Yersinia, Escherichia, Salmonella, Shigella, Klebsiella.В основе метода лежит поиск нуклеотидных последовательностей, кодирующих биосинтез и транспорт сидерофоров, в геномах различных штаммов вышеперечисленных родов бактерий.
Проведенный анализ дает возможность оценить наличие и разнообразие в геномах бактерий кластеров генов, участвующих в процессе поглощения микробами железа в организме хозяина. Обнаружение у исследуемых штаммов множественных сидерофор-зависимых систем ассимиляции железа может свидетельствовать о повышенном патогенном потенциале бактерий. Полученные данные могут быть использованы для выявления опасных для человека штаммов.
Читать полностью…
• Monday, February 27th, 2023
25 февраля 2023 года в г. Ростове-на-Дону на территории Парка культуры и отдыха 1 Мая состоялась церемония возложения цветов к памятнику великому советскому микробиологу и эпидемиологу Зинаиде Виссарионовне Ермольевой сотрудниками ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора и ФКУЗ Ставропольский противочумный институт Роспотребнадзора. Читать полностью…
80 лет со дня освобождения г. Ростова-на-Дону от немецко-фашистских захватчиков.
РОСТОВЧАНЕ ПОМНЯТ СВОИХ ГЕРОЕВ
Когда фашисты рвались к Дону, чтоб захватить потом Кавказ,
Наш город стал для них заслоном, такое было много раз:
Ростов бомбили самолеты, стреляли пушки, танки жгли…
Читать полностью…
В рамках профориентационной работы со студентами медико-профилактического факультета Ростовского государственного медицинского университета по инициативе директора ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора А.К. Носкова и ректора ФГБОУ ВО РостГМУ Минздрава России С.В. Шлык в период с 1 по 3 февраля 2023 года проведен первый цикл мероприятий научно-практического кружка, Читать полностью…
29 декабря 2022 г. в ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора состоялось заседание заключительного Учёного совета, на котором были подведены итоги уходящего года. Читать полностью…
• Tuesday, December 20th, 2022
20 декабря 2022 г. исполняется 100 лет со дня рождения заслуженного врача Российской Федерации Анатолия Мордковича Зайдёнова.
В 1966 году выпускник Ленинградской военно-медицинской Академии, кандидат медицинских наук, высококвалифицированный специалист в области эпидемиологии, микробиологии и диагностики особо опасных инфекционных болезней Зайдёнов А.М. начинает свой путь в стенах Ростовского-на-Дону противочумного института. В нашем институте Анатолий Мордкович на протяжении 12 лет, с 1975 по 1987 гг., возглавлял отдел эпидемиологии. В 70-ые годы он принимал участие в ликвидации очагов холеры. Читать полностью…
• Monday, December 12th, 2022
День Конституции Российской Федерации, который отмечается ежегодно 12 декабря, — одна из значимых памятных дат российского государства.
В этот день в 1993 году всенародным голосованием была принята Конституция Российской Федерации. Полный текст Конституции был опубликован в «Российской газете» 25 декабря 1993 года. С 1994 года, согласно Указам Президента России день 12 декабря был объявлен государственным праздником.
Читать полностью…
• Wednesday, December 07th, 2022
День Героев Отечества в России — это памятная дата, которая отмечается ежегодно 9 декабря. Она установлена Федеральным законом Российской Федерации № 22-ФЗ от 28 февраля 2007 года.
Свою историю праздник ведёт ещё с 18 века. Эта декабрьская дата приурочена к выдающемуся событию эпохи правления императрицы Екатерины II — в 1769 году она учредила орден Святого Георгия Победоносца. Орден Святого Георгия имел 4 степени отличия, из которых первая была наивысшей. Кавалерами всех четырёх степеней стали четыре человека, среди которых великие русские полководцы Михаил Кутузов и Михаил Барклай-де-Толли. Екатерина II удостоила и себя этой награды в честь учреждения ордена. Читать полностью…
• Wednesday, November 30th, 2022
Сегодня отмечается государственный праздник – День Герба Российской Федерации. С 30 ноября 1993 года гербом России является двуглавый орёл – символ Российской империи, а ещё раньше империи Византийской. Орёл с двумя головами был гербом России со времён правления Ивана III. Двуглавый орёл оставался на гербе России до 1918 года, то есть дольше пяти веков. В 1993 году он вернулся «на своё место». Золотой двуглавый орёл на красном поле сохраняет историческую преемственность России, отражает её евро-азиатскую сущность. Одна голова орла направлена на запад, а другая на восток. Однако символы, которые изображены на гербе России, имеют гораздо более долгую историю, уходящую корнями в период становления Московского княжества. Герб представляет собой взаимосвязанную систему образов и цвета, которая несёт идею целостности государства и неразрывно связан с её историей, традициями и ментальностью. Внешний вид этого официального знака закреплен в Конституции Российской Федерации.
17 ноября 2022 года в ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора состоялся Ученый совет, на котором директор А.К. Носков торжественно вручил ведущим ученым института книги, посвященные жизни и научной деятельности великого советского микробиолога и эпидемиолога Зинаиды Виссарионовны Ермольевой.
В книгу включена информация об органах и учреждениях Роспотребнадзора в Ростовской области, считающих себя последователями З.В. Ермольевой. Алексей Кимович пожелал всем читателям новых открытий и успехов в достижении намеченных целей. Читать полностью…
В ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора, на базе отдела профессиональной переподготовки и повышения квалификации специалистов с 31 октября 2022 г. по 11 ноября 2022 г. был проведен очно-заочный цикл повышения квалификации для специалистов санитарно-эпидемиологической службы Донецкой и Луганской Народных Республик по программе «Лабораторная диагностика и эпидемиологический надзор за холерой». Читать полностью…
• Wednesday, November 02nd, 2022
2 ноября 2022 года в г. Ростове-на-Дону на территории Парка культуры и отдыха 1 Мая состоялась церемония возложения цветов к памятнику великому советскому микробиологу и эпидемиологу Зинаиде Виссарионовне Ермольевой. Жизнь Зинаиды Виссарионовны – это подвиг и пример беззаветного и самоотверженного служения науке и людям!
В церемонии приняли участие директор ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора А.К. Носков и ведущие ученые института. Вечная слава и вечная память Зинаиде Виссарионовне, совершившей важнейшие открытия во имя сохранения здоровья и жизни наших соотечественников! Подвиг настоящего врача, беззаветно преданного Родине и своему признанию, вечно будет жить в наших сердцах!
Читать полностью…
5 октября 2022 года в Ростовском государственном музыкальном театре состоялось торжественное мероприятие, посвященное празднованию 100-летия со дня образования государственной санитарно-эпидемиологической службы России. Читать полностью…
• Monday, October 03rd, 2022
В Ростове-на-Дону торжественно открыли 1 октября памятник советскому микробиологу и эпидемиологу, создательнице антибактериальных и противовирусных препаратов Зинаиде Виссарионовне Ермольевой.
В годы Великой Отечественной войны благодаря крустозину были спасены жизни сотен тысяч бойцов-красноармейцев, а производство холерного бактериофага, запущенное З.В. Ермольевой в Сталинграде, предотвратило вспышку этой страшной болезни в осажденном городе.
В церемонии приняли участие помощник Президента России Владимир Мединский, руководитель Роспотребнадзора Анна Попова, губернатор Ростовской области Василий Голубев, внучатая племянница Ермольевой Татьяна Бугаёва, представители органов исполнительной власти и научных учреждений, студенты и школьники.
Читать полностью…
• Friday, June 17th, 2022
17 июня 2022 года в Ростовском-на-Дону противочумном институте состоялось торжественное собрание, посвящённое предстоящему Дню медицинского работника – одного из самых значимых и почитаемых профессиональных праздников в нашей стране. Читать полностью…
С 4 по 11 мая 2022 года в ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора состоялся семинар по холере в режиме ВКС для специалистов территориальных органов и организаций Роспотребнадзора, специалистов медицинских организаций и специалистов бактериологических лабораторий в субъектах Российской Федерации. Читать полностью…
