30 июля 2019 года в 10.00 в конференц-зале ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора состоялась научно-практическая конференция, на которой был представлен доклад: «Изучение штаммов Yersinia pestis, отнесенных при выделении к виду Yersinia pseudotuberculosis». Авторы: Трухачев А.Л., Водопьянов А.С., Водопьянов С.О., Писанов Р.В., Лебедева С.А., Мелоян М.Г., Арсеньева Т.Е., Морозова И.В., Кузнецова Д.А., Рыкова В.А., Подладчикова О.Н., Чемисова О.С., Титова С.В.
Докладчик: заведующий лабораторией микробиологии чумы и других иерсиниозов, к.м.н. Трухачев Алексей Леонидович.
Ведущий научной конференции — заведующий лабораторией гибридом, проф., д.б.н. Алексеева Людмила Павловна.
Рецензент – руководитель группы молекулярной биологии лаборатории микробиологии холеры, д.б.н. Монахова Елена Владимировна.
Настоящее исследование показало, что анализ отдельных генов и фрагментов геномной ДНК достаточен для целей меж- и внутривидового типирования с установлением таксономического положения штамма. Более тонкое изучение структурной организации геномов может уже осуществляться с помощью полногеномного секвенирования и дальнейшего анализа его результатов. В этой связи представляется правомерным поиск алгоритма исследования штаммов, например, вновь выделенных, который бы позволял решать конкретные задачи по их характеристики. Оптимизация числа изучаемых мишеней может быть экономически эффективным и целесообразным решением в ряде случаев лабораторной диагностики и на первых этапах изучения генома штаммов. В настоящем исследовании авторы предложили алгоритм, при котором изучение штаммов Y. pestis проводится высокотехнологичными методами, включающими масс-спектроскопию, полногеномное секвенирование с анализом результатов с помощью специализированных авторских компьютерных программ, ПЦР-анализ, с использованием различных праймеров, для характеристике штаммов. Полученные результаты позволяют рекомендовать авторские программы к использованию для изучения геномов штаммов возбудителя чумы, оценки их таксономического положения, определения их видовой принадлежности и проведения внутривидовой дифференциации.
