22 марта 2018 года в 10.00 в конференц-зале ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора состоялась научно-практическая конференция, на которой был представлен доклад на тему: «Транскрипционный анализ экспрессии генов островка VcB V. cholerae методом полногеномного секвенирования». Авторы: Водопьянов С.О., Водопьянов А.С., Писанов Р.В., Иванов С.А., Мишанькин Б.Н., Олейников И.П.

Докладчик: д.м.н., зав. лаборатории биохимии микробов Водопьянов Сергей Олегович

Ведущим научной конференции явилась – к.х.н. Подладчикова Ольга Николаевна.

Рецензент – д.б.н., руководитель группы молекулярной биологии Монахова Елена Владимировна.

В докладе был представлен анализ экспрессии генов V. cholerae, входящих в состав островка патогенности VcB, с помощью приема полногеномного секвенирования транскриптома. Островок был обнаружен только у tcpA+ холерных вибрионов и распологался на второй хромосоме. В работе были использованы два штамма V. cholerae О1 ctxA+ tcpA+ и один штамм V. cholerae O1 ctxA- tcpA-. Пул суммарной РНК выделяли по методике, основанной на дифференциальном осаждении в присутствии ионов лития. В суммарном пуле секвенированной РНК была идентифицирована транслируемая РНК более 3500 известных генов холерного вибриона. В составе пула суммарной РНК, выделенной из двух токсигенных штаммов, были обнаружены РНК-транскрипты пяти генов, входящих в островок патогенности VcB, исключая ген VCA0282, идентифицированный ранее как ISVch5 транспозаза. В составе пула суммарной РНК из штамма V. cholerae O1 ctxA- tcpA- не были обнаружены транскрипты двух генов – ранее описанного VCA0282 транспозазы и VCA0283. Возможным объяснением может быть существование копий этих генов в других участках генома вибрионов ctx-tcpA-.

Итогом конференции явилось решение всех присутствующих и рецензента о представлении данных доклада в виде статей к опубликованию в журнале ВАК.