The Rostov-on-Don Antiplague Institute was established by Order of the Authorized Council of Labor and Defense dated from June 5th, 1934 No. 1.
The main directions of the Institute work from the moment of its foundation to the present times are the improvement of epidemiological surveillance of specially dangerous and other natural-focal infectious, the laboratory diagnostics and disease prevention, as well as biological safety and counteraction to bioterrorism.
During 1934 – 1940, epizootological examinations of natural foci of dangerous infections in the North-Western Caspian region, performed original studies on epizootology, epidemiology, pathogenesis and immunogenesis of plague and tularemia were conducted in the institute. Nine employees of the institute were awarded the Stalin Prize for plague elimination on the territory of the North-Western Caspian.
During the hard years of the Great Patriotic War, the institute makes a great contribution into elimination of vast epidemic outbreaks of tularemia and cholera in Rostov, Stalingrad (Volgograd nowadays) and Astrakhan regions.
Подробнее
В 2023 г. подготовкой заключительных и промежуточных отчетов было завершено выполнение 12 НИР в рамках Отраслевой программы на 2021-2025 гг., 2 из которых выполнены в соавторстве с другими институтами.
Подробнее
В 2024 г. в соответствии с планом основных мероприятий ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора будут выполняться 13 государственных НИР (12 НИР – в рамках Отраслевой программы на 2021–2025 гг., 1 НИР – в рамках Государственной программы «Обеспечение химической и биологической безопасности Российской Федерации» 2021-2024 гг.) и 3 мероприятия в рамках реализации федерального проекта “Санитарный щит страны – безопасность для здоровья (предупреждение, выявление и реагирование)”.
Подробнее
Программа «RabiesAnalyzer» предназначена для анализа мутаций и определения группы принадлежности изолятов вируса бешенства Rabies lyssavirus по загруженной последовательности полного генома или N гена. В качестве исходных данных используется файл в fasta-формате, содержащий последовательность генома или N гена исследуемого изолята.
Программа предназначена для работы в операционной системе Linux и требует установки ряда дополнительных программ (файл environment.yml с перечнем требуемых программ находится в папке с программой).
Программа «Yersinia pseudotuberculosis Analyzer» предназначена для анализа полногеномных последовательностей штаммов Yersinia pseudotuberculosis с целью определения наличия генов вирулентности и плазмид, анализа генов, отвечающих за определение серотипа, а также определения INDEL-локусов с высокой разрешающей способностью.
The program developed in the Russian Federation, KlebsiellaAnalyzer allows typing and analysis of whole-genome sequencing data of clinical isolates of Klebsiella pneumoniae. The programming languages Java and Python were used for software development.
The program’s ability to determine the type of capsular antigen based on batch data from whole-genome sequencing. The analysis program includes:
- Genes rmpA, rmpA2 are responsible for hypermucoid properties. The detection of one or both genes indicates that the genome under study belongs to the hypermucoid genotype. In the absence of the rmpA and rmpA2 genes, the strain under study should be classified as the classical type.
- Determination of the presence of virulence genes: 14 virulence genes are included in the program: magA, allS, mrkD, cf29a, fimF, uge, kfuA, kfuB, kfuС, kvgA, ureA2, copA2, nikA2, yciC.
- Genes for yersiniobactin synthesis: ybtS, ybtA, irp1, irp2, ybtT, psn.
- Aerobactin synthesis genes: iucA, iucC, iutA, iutA2, entA, entB, entE, fepG, fepE, fepA, pfeA_2, fes_3. Salmohelin synthesis gene iroB.
INDEL markers: the program includes 19 proprietary INDEL markers for comparative typing of the studied strains.
To detect the presence of extrachromosomal elements, the program includes genes encoding replicons of plasmids found in various world and Russian strains of Klebsiella pneumonae: IncHI1B (230kb), repB (230kb), incFII (95kb), IncFIB (230kb), IncK (54-224kb), ColRNAI, Col440I, repE_IncFIA(HI1)(95kb), IncR. During the analysis, the number of detected replicons corresponds to the number of plasmids in the strain under study.
The program provides CRISPR typing: CRISPR are special loci consisting of direct repeating sequences separated by spacers. The program includes two types of CRISPR identified in Klebsiella pneumoniae strains. The presence of the type and size of the CRISPR cassette in the genomes of the studied strains is assessed by software.
Программа «Fragment Extractor» предназначена для анализа данных фрагментарного и полногеномного секвенирования с целью поиска различных нуклеотидных последовательностей. Дополнительными функциями программы являются возможность трансляции найденной нуклеотидной последовательности в аминокислотную и вывод фланкирующих участков. Для запуска программы достаточно распаковать скачанный архив с программой и запустить файл FragmentExtractor.bat или FragmentExtractor.jar
Скачать
«Ворота Кавказа» оккупировались гитлеровцами и их союзниками дважды. Первый раз, осенью 1941 года, гитлеровцы смогли захватить Ростов всего на неделю. Впрочем, и эти дни запомнились местному населению кровавыми убийствами мирных жителей. Так, 28 ноября 1941 г. был расстрелян гитлеровцами юный Виктор Черевичкин, слава о котором позже разнеслась по всему Советскому Союзу. Уже 28 ноября 1941 г. советские войска под командованием маршала С.К. Тимошенко смогли освободить Ростов-на-Дону. Это стало первой масштабной победой Красной Армии на начальном этапе Великой Отечественной войны.
Читать полностью…
Монографии
- Лабораторная диагностика лихорадки Ку: практическое руководство / Н.В. Рудаков, С.Н. Шпынов, Н.К. Токаревич, А.К. Носков, Ю.А. Панферова, С.Ю. Красоткина, Н.Л. Пичурина, Е.Н. Сокиркина, Д.И. Симакова, О.С. Чемисова. – Омск: Издательский центр КАН, 2023. – 84 с. Читать полностью…
28 декабря 2023 г. в ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора состоялось заседание заключительного Учёного совета, на котором были подведены итоги уходящего года и обсуждены перспективы на 2024 год. Читать полностью…
Resistance Analyzer – оффлайн программа для поиска генов антибиотикорезистентности в данных полногеномного секвенирования. Программа предназначена для работы в среде Windows.
Авторы: Водопьянов А.С., Писанов Р.В.
Язык программирования: Java
Скачать
02.10.2023 г. конкурсной комиссией ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора проведен конкурс на замещение вакантных должностей научных работников. В работе конкурсной комиссии приняли участие 10 из 10 членов конкурсной комиссии. Читать полностью…
15 сентября 2023 года в г. Ростове-на-Дону на территории Парка культуры и отдыха 1 Мая состоялось торжественное мероприятие, посвящённое дню образования государственной санитарно-эпидемиологической службы России. Читать полностью…
Уважаемые коллеги!
Примите искренние поздравления с днём образования санитарно- эпидемиологической службы Российской Федерации!
Государственная санитарно-эпидемиологическая служба России обеспечивает санитарно-эпидемиологическое благополучие населения страны, несёт ответственность за жизнь и здоровье каждого гражданина, защищая от опасных инфекционных болезней. Наша общая благородная миссия ‒ сохранение здоровья населения России.
Читать полностью…
В ФКУЗ Ростовском-на-Дону противочумном институте Роспотребнадзора планируется строительство клинико-диагностического центра.
https://disk.yandex.ru/i/tEkrVPSNz6Nlsg
30 июня 2023 года в завершении второго цикла мероприятий научно-практического кружка, организованного в рамках профориентационной работы со студентами медико-профилактического факультета Ростовского государственного медицинского университета по инициативе директора ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора А.К. Носкова и ректора ФГБОУ ВО РостГМУ Минздрава России С.В. Шлык, Читать полностью…
Программа «MLSTtyper» предназначена для анализа данных полногеномного секвенирования возбудителей бактериальных инфекций с целью определения аллелей генов, используемых для типирования, и MLST-типа. Принципиальными особенностями программы являются офлайн режим работы (без доступа к сети Интернет) и возможность автоматического анализа большого числа геномов.
Скачать
Скачать Методические рекомендации по работе с программой
Читать полностью…
Программа «Pseudomonas Analyser» предназначена для анализа данных полногеномного секвенирования штаммов Pseudomonas aeruginosa с целью определения антигенной структуры, жгутикового антигена, выявления факторов патогенности, генов определяющих мукоидный фенотип микроорганизма, определения INDEL-локусов с высокой разрешающей способностью.
Скачать Pseudomonas Analyser
- Загрузить полную версию – предназначена для компьютеров с операционной системой Windows XP, 7, 8 без установленной виртуальной машины JAVA (JRE). В этом случае для запуска программы достаточно распаковать скачанный архив с программой и запустить файл PseudomonasAnalyser.bat
- Загрузить исполняемый файл – предназначен для компьютеров с установленной виртуальной машиной JAVA (JRE) на базе Windows, Linus, Mac OS X. При необходимости свежую версию JRE можно бесплатно скачать с официального сайта компании Oracle (www.oracle.com). При этом запускаемым файлом является PseudomonasAnalyser.jar
- Загрузить методические рекомендации по использованию программы Pseudomonas Analyser.
5 мая 2023 года в ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора состоялось торжественное возложение цветов к мемориальной доске сотрудникам, погибшим на фронтах Великой Отечественной войны 1941–1945 годов: заместителю директора по АХЧ Шадрину, начальнику технического отдела Н.Т. Шульгину, бухгалтеру Е.М. Алексееву, инженеру М.А. Косинкову, научному сотруднику А.П. Яковлеву, зоологу Л.М. Губареву, заведующему складом Н. Мазину, шофёру В.И. Ванушенко, Н. Хасанжиеву и конюху Куценко. Читать полностью…
Уважаемые коллеги!
Примите сердечные поздравления с самым значимым для нас праздником ‒ Днём Победы в Великой Отечественной войне! 9 мая ‒ это символ героизма и беспримерного мужества нашего народа, отстоявшего мир на земле, а 1941-1945 годы ‒ одни из самых героических страниц в истории Отечества. Пусть эта Победа, этот важный подвиг наших дедов и прадедов навеки сохранится в памяти последующих поколений! Мы выражаем особую признательность тем, кто в эти дни мужественно выполняет свой воинский долг на поле боя. Пусть над нами всегда будет мирное небо, а в каждом доме ‒ счастье, благополучие и любовь! С праздником!
Директор ФКУЗ Ростовский-на-Дону
противочумный институт Роспотребнадзора А.К. Носков
27–28 апреля 2023 года состоялся конгресс с международным участием «Молекулярная диагностика и биобезопасность — 2023». В рамках научной программы конгресса, включающей 19 тематических секций и 145 докладов на самые актуальные темы современной эпидемиологии, молекулярной диагностики и биобезопасности, выступили с докладом сотрудники лаборатории молекулярной биологии природно-очаговых и зоонозных инфекций ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора: Читать полностью…
Программа «V. cholerae ICE Genotyper» предназначена для анализа данных полногеномного секвенирования штаммов Vibrio cholerae с целью выявления интегративно-конъюгативного элемента (ICE-элемента) и определения его типа. Возможна пакетная обработка множества fasta-файлов (каждый файл содержит геном одного штамма).
Авторы
Водопьянов А.С., Водопьянов С.О., Писанов Р.В.
Скачать программу
Скачать методические рекомендации
Программа «Salmonella Analyzer» предназначена для анализа данных полногеномного секвенирования штаммов Salmonella spp. с целью определения антигенной структуры, выявления факторов патогенности, определения INDEL-локусов с высокой разрешающей способностью.
Авторы
Горох А.М., Водопьянов А.С., Писанов Р.В., Водопьянов С.О., Герасименко А.А.
Читать полностью…
19 апреля 2023 года в г. Ростове-на-Дону участники ежегодной региональной научно-практической конференции, посвященной памяти доктора медицинских наук, профессора Тамары Алексеевны Кондратенко «Современные особенности эпидемиологии и профилактики инфекционных болезней в отдельных субъектах Российской Федерации» возложили цветы к памятнику великому советскому микробиологу и эпидемиологу Зинаиде Виссарионовне Ермольевой, научные открытия которой и сейчас используют в различных областях медицины и находят продолжение в деятельности ее учеников и последователей. Читать полностью…
Программа для выявления генов, отвечающих за синтез сидерофоров, в полногеномных нуклеотидных последовательностях энтеробактерий
Разработанная программа позволяет проводить анализ данных секвенирования таких представителей энтеробактерий, как Yersinia, Escherichia, Salmonella, Shigella, Klebsiella.В основе метода лежит поиск нуклеотидных последовательностей, кодирующих биосинтез и транспорт сидерофоров, в геномах различных штаммов вышеперечисленных родов бактерий.
Проведенный анализ дает возможность оценить наличие и разнообразие в геномах бактерий кластеров генов, участвующих в процессе поглощения микробами железа в организме хозяина. Обнаружение у исследуемых штаммов множественных сидерофор-зависимых систем ассимиляции железа может свидетельствовать о повышенном патогенном потенциале бактерий. Полученные данные могут быть использованы для выявления опасных для человека штаммов.
Читать полностью…
25 февраля 2023 года в г. Ростове-на-Дону на территории Парка культуры и отдыха 1 Мая состоялась церемония возложения цветов к памятнику великому советскому микробиологу и эпидемиологу Зинаиде Виссарионовне Ермольевой сотрудниками ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора и ФКУЗ Ставропольский противочумный институт Роспотребнадзора. Читать полностью…
80 лет со дня освобождения г. Ростова-на-Дону от немецко-фашистских захватчиков.
РОСТОВЧАНЕ ПОМНЯТ СВОИХ ГЕРОЕВ
Когда фашисты рвались к Дону, чтоб захватить потом Кавказ,
Наш город стал для них заслоном, такое было много раз:
Ростов бомбили самолеты, стреляли пушки, танки жгли…
Читать полностью…
В рамках профориентационной работы со студентами медико-профилактического факультета Ростовского государственного медицинского университета по инициативе директора ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора А.К. Носкова и ректора ФГБОУ ВО РостГМУ Минздрава России С.В. Шлык в период с 1 по 3 февраля 2023 года проведен первый цикл мероприятий научно-практического кружка, Читать полностью…
Монографии
- Кононенко, А.А. Опыт внедрения в образовательный процесс новых технологий обучения медицинских работников в условиях пандемии COVID-19 / А.А. Кононенко, Н.Л. Пичурина, С.Ю. Водяницкая, Ф.В. Логвин, В.В. Баташев, Н.Г. Тютюнькова, Е.Г. Соболева, А.К. Носков, А.С. Черная, Л.Ф. Черниговец, Е.А. Максимова, И.К. Дорофеева // COVID-19 в Ростовской области : монография / под.ред. Главного государственного санитарного врача по Ростовской области Е.В. Ковалёва. – Ростов-на-Дону, 2022. – Глава XVII. – С.424-432. [Электронный ресурс]
- Носков, А.К. ФКУЗ «Ростовский-на-Дону ордена Трудового Красного Знамени научно-исследовательский противочумный институт»: Из прошлого в настоящее / А.К. Носков, О.С. Чемисова, Е.И. Марковская, О.Ф. Кретенчук, В.А. Коршенко, С.А. Лебедева // Попова А.Ю., Е.В. Ковалёв, Т.И. Твердохлебова. Зинаида Ермольева : наука и жизнь / Под редакцией д.м.н, профессора А.Ю. Поповой.- Глава 4.- Ростов-на-Дону: ИП Ютишев А.С., 2022. – С.227-247
- Подвиг во имя жизни. 125 лет противочумным учреждениям России и стран СНГ / под ред. д-ра мед. наук проф. А.Ю. Поповой, акад. РАН, д-ра мед. наук, проф. В.В. Кутырева. – Калининград: РА «Полиграфычъ», 2022. – 532 с.
- COVID-19 в Ростовской области: монография / под ред. Главного государственного санитарного врача по Ростовской области Е.В. Ковалева. – Ростов-на-Дону, 2022 – 442 с.
29 декабря 2022 г. в ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора состоялось заседание заключительного Учёного совета, на котором были подведены итоги уходящего года. Читать полностью…